杜明海(刘欢 饰)问到东方靖琪(张钧甯 饰)跟自己离开考虑的如何，东方靖琪顾及药厂、孤儿院和杜家还有那么多人她不能说走就走，她还要再考虑考虑。仓桥(齐欣 饰)向秋田(李俊贤 饰)汇报运到前线的红伤药没有一点疗效，秋田勃然大怒。周山口(黄垲翔 饰)明明掌握了红伤药所有工序，秋田顿时明白东方靖琪从中做了手脚。他到远山药厂质问东方靖琪，东方靖琪义正辞严地表示自己不可能为日本人制药。秋田突然抬手打死一个工人，他说再生产不出有效的药品他就每天打死一个工人。秋田傲慢地离开，众工人愤怒地目眦尽裂。东方靖琪终于做了当机立断的决定。周山口继续在东方靖琪面前做出深情蜜意的样子，东方靖琪故意长吁短叹地表示自己心力交瘁，她希望周山口带自己离开。接着她又说自己现在只有他一个信任的人，她希望周山口去帮自己去取神农药典，他们拿到书就马上离开暨阳。她告诉周山口药典藏在晋安九峰山悬空寺里。周山口按捺不住心中的狂喜忙不迭地答应帮忙取书。东方靖琪去找了阿祥，她为阿祥治过伤，阿祥对她感恩戴德。东方靖琪希望他帮忙把周山口独自去找药典的事透漏给杜明江(周铁 饰)。很快，杜明江便把此事报告给秋田。秋田恼怒地半路拦截住周山口，他命令杜明江和周山口一起去找书。走之前杜明江让何家宝(刘韦伯 饰)留下来密切监视东方靖琪。何家宝在跟踪东方靖琪时发现她把药厂现银全部提走，他拦截住东方靖琪质问她是不是要逃走。歪脖及时赶到打晕何家宝。东方靖琪离厂前默默地看着凝聚着杜远山(谢园 饰)和自己心血的药厂心中百感交集，因为她已经计划好离开前炸了厂房不让它落到日本人手里。东方靖琪回到杜府，然后从杜家祠堂里取出藏在这里的神农药典。她跪在杜远山灵位前焚烧了药典，她说自己已经把书籍里的内容全部记在脑海里，书籍不能落入日本人手里。东方靖琪又劝大太太离开，大太太却固执地要和杜府共存亡。东方靖琪只好劝她保重，然后她带走了孤儿院所有孩子。周山口从晋安回来心有不甘，他不知道为什么没有在那里找到神农药典。他要去找东方靖琪询问，杜明江不无鄙夷地告诉他，东方靖琪早就对他生疑，这次取书完全是为了支开他。周山口不信，直到找不到东方靖琪又看到她留给自己的信后，他才知道东方靖琪早在刑场他询问自己药典下落时就开始怀疑他。此时在杜家念经的大太太早就心灰意冷，所以在蜡烛倒塌点燃佛堂帷幔时她听之任之，直到杜府燃起熊熊大火，大太太脸上露出解脱后的笑葬身火海。紧接着马致远(郭冬冬 饰)点燃炸药，远山药厂在爆炸声中被夷为平地。秋田气急败坏。秋田集合所有日军对东白山发动进攻。杜明海让杜明溪(谢闻轩 饰)带着东方靖琪和孤儿院的孩子赶紧撤离，很快秋田带着日军与杜明海的部队交上火。东方靖琪让杜明溪带着孤儿院孩子离开，她坚持要回去找杜明海。半路上周山口突然拦住东方靖琪，他愤怒地指责东方靖琪欺骗自己并让她交出神农药典。他冷笑着告诉东方靖琪自己是个日本人，只有日本人才配拥有神农药典这样的书籍。就在他拿枪胁迫东方靖琪时，东方靖琪却乘其不备突然掏枪打死了他。此时杜明海带着新四军与秋田展开激烈枪战，枪战中杜明江和何家宝双双被打死结束了他们罪恶耻辱的一生。然而在最后的肉搏战时，杜明海打死了秋田却被两个背后偷袭的日军用刺刀刺透胸膛。战争结束后，东方靖琪被任命接管新四军被服厂、修械所和药厂。东方靖琪脸上露出坚强的表情，她要继续杜明海没有完成的抗日大计。东方靖琪带着长顺来到杜明海墓前，她在心中默默地告诉杜明海，他没有白白牺牲，所有孤儿已经安全转移，自己一定会把长顺抚养长大，因为他们就是未来的希望和力量……（全剧终）
